バイオインフォマティクス相談部会代表
理化学研究所 生命機能科学研究センター
堀之内 貴明 

⇒研究概要図pdf

　高速DNAシークエンス解析技術をはじめとする分析技術の普及とコンピュータによる計算処理能力の向上に伴い、誰でも比較的容易に生命情報ビックデータにアクセスし、解析することが可能となりつつある。これら膨大な生命情報から有用情報を抽出する為には、ビックデータを実際どのように扱うかが決め手になる。その為、生命情報ビックデータを論理的かつ効率的に分析し、生命を理解する手段、バイオインフォマティクス解析が生物工学分野において今後ますます重要になってくる。しかしながら、このバイオインフォマティクス解析は、高度な専門知識を要し、さらにターゲットや目的によって多種多様である為、未経験者にとっては敷居が高く、またそれを総合的にサポートするコミュニティが生物工学分野には存在しないことから、各研究者が独力で個別問題に取り組まざるを得ない。この状況を打破するために、生物工学分野にフォーカスした解析サポート環境の整備や交流の場の形成、バイオインフォマティクスがわかる（できる）生物工学研究者の育成が急務である。
　そこで、バイオインフォマティクス解析手法に精通した生物工学研究者から構成される部会を設立し、これを一種のバイオインフォマティクス解析相談窓口として有機的に機能させる。さらに、関連研究の勉強会や講演会を企画し、最先端の解析手法を発信していくことを通じて、本部会を関連研究者交流の場や産業界からのニーズに答える場とし、生物工学会として情報解析分野の活性化と人材育成の促進を行う。

バイオインフォマティクスに興味のある方々はぜひ本部会の活動にご参加ください。当ページ下部に活動内容一覧を記しております。

 

バイオインフォマティクス相談部会　活動紹介

■お知らせ

・生物工学会誌の連載記事「続・間違いから学ぶ実践統計解析」（松田史生先生・川瀬雅也先生）にバイオインフォマティクス相談部会が登場しました（第1回　第2回）。

・第三回講演会（11月20日　京都大学）を開催します。今回はバイオ計測サイエンス研究部会との共催行事です。

・本部会の相談窓口をきっかけにした共同研究の論文が公開されました(2019年8月27日)。

 

活動内容


■相談窓口
　各種のバイオインフォマティクス解析手法に精通した生物工学研究者により構成される相談窓口を運営しております。下記ページにお進みください。
　バイオインフォマティクス相談窓口

■一般部会員メーリングリスト
　生物工学会におけるバイオインフォマティクス分野の活性化と情報共有、交流を目的として、部会メーリングリスト（ML）を運営しております。一般部会員になっていただくことでMLに登録され、当該分野の関連情報や部会が主催するイベント等の告知についてのメールを受信できます。またMLに情報を発信することも可能です。
　一般部会員への登録をご希望の方は、メールの件名または本文に「バイオインフォマティクス相談部会　一般部会員希望」とご記入の上、代表宛（E-mail）までご連絡下さい。

■各種研究会合の開催
　生物工学分野の内外から、バイオインフォマティクス技術を利活用されている先生方をお招きし、交流の場を設けております。奮ってご参加下さると幸いです。

 

■活動記録

2019主催：　第三講演会　～大規模計測技術とインフォマティクスと自動化～　京都大学（2019/11/20）　⇒  開催報告
※バイオ計測サイエンス研究部会との共催
共催：　第71回日本生物工学会大会　シンポジウム「ペアで紹介します、WetとDryの融合研究」　岡山大学（2019/9/18）　⇒  開催報告
共催：　バイオインフォマティクス出張相談窓口（2019年度若手会夏のセミナー内での開催）　滋賀県高島市　（2019/7/20）⇒  開催報告
寄稿：　特集　生物工学分野におけるバイオインフォマティクス技術の利活用の現状と展望（生物工学, 97(5) , 2019）
主催：　深層学習ハンズオンセミナー　東京都千代田区　(2019/3/9)　⇒  開催報告
2018
主催：　第二回講演会　東京大学　（2018/12/5）⇒  開催報告
出展：　第70回日本生物工学会大会附設展示会　関西大学  (2018/9/5 – 9/7)　⇒  開催報告
共催：　バイオインフォマティクス簡易相談ブース+解析体験デモ（2018年度若手会夏のセミナー内での開催）　北見工業大学　（2018/6/30 – 7/1）⇒  開催報告
寄稿：　2017年度研究部会活動報告（生物工学, 96(5), pp. 304, 2018）
企画協力：　第5回SBJシンポジウム（2018/5/25）
2017主催：　第一回講演会　大阪大学（2017/12/26）⇒  開催報告
共催：　第69回日本生物工学会大会　シンポジウム「集え！バイオインフォマティクスを利活用する生物工学若手研究者」　早稲田大学（2017/9/12）
主催：　第一回勉強会　名古屋大学（2017/8/10）⇒  開催報告
2016　第68回日本生物工学会大会　シンポジウム「生物工学若手研究者の生命情報との向き合い方 ～バイオインフォマティクス入門から応用へ～」　富山国際会議場（2017/9/28)
※このシンポジウムの開催が部会発足のきっかけとなりました。

 

■相談窓口業績(共著)

・Ohtsuka, H., Kato, T., Sato, T., Shimasaki, T., Kojima, T., and Aiba, H. Leucine depletion extends the lifespans of leucine-auxotrophic fission yeast by inducing Ecl1 family genes via the transcription factor Fil1. Mol. Genet. Genomics.  294, 1499–1509 (2019)

・蟹江慧、玉田正樹、池田友里圭、佐々木寛人、外川文雄、加藤竜司:細胞培養作業の数量的記述および理解のためのデータ解析. 2019年度生物工学若手研究者の集い（若手会）夏のセミナー, 令和元年7月 高島

・名古屋大学大学院 生命農学研究科 分子生物工学研究室, 名城大学大学院 農学研究科 応用微生物学研究室, 石川県立大学 生物資源研 環境生物工学研究室:醸造微生物、麹菌のもつ食品機能：腸内細菌叢改善と大腸炎緩和作用. 名古屋大学予防早期医療創成センター第9回ワークショップ, 令和2年1月 名古屋

運営委員

代表堀之内 貴明（理研・生命機能科学研究センター）
幹事長兒島 孝明 (名大院・生命農学)
会計蟹江 慧 (名大院・創薬科学)
委員
(順不同)

加藤 竜司 (名大院・創薬科学)
中杤 昌弘 (名大院・医)
牧野 智宏 (第一三共（株）)
松田 史生 (阪大院・情報科学)
Jasmina DAMNJANOVIC (名大院・生命農学)
宮本 義孝 (国立成育医療研究センター)
今中 洋行 (岡山大院・自然科学)
青木 航 (京大院・農)
相馬 悠希 (九大・生体防御医学研究所)
戸谷 吉博 (阪大院・情報科学)
大野 聡 (東大院・理)
豊島 正和 (阪大院・情報科学)
原 啓文 (マレーシア工科大・マレーシア日本国際工科院)
馬場 保徳 (石川県大・生物資源研)
津川 裕司 (理研・CSRS, 理研・IMS)
小野 直亮 (奈良先端大・データ駆動型サイエンス創造センター)
前田 和勲 (九工大院・若手研究者フロンティア研究アカデミー)
岡橋 伸幸 (阪大院・情報科学, 理研・IMS)

お問合せ先

理化学研究所 生命機能科学研究センター
堀之内 貴明　E-mail

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