Published by 学会事務局 on 15 5月 2023
【研究部会】スローフード共生発酵工学研究部会 発酵食品機能性データベース更新のお知らせ
スローフード共生発酵工学研究部会では発酵食品機能性データベースを更新しました。⇒詳しくはこちら
Published by 学会事務局 on 31 3月 2021
【研究部会】スローフード共生発酵工学研究部会 発酵食品機能性データベース更新のお知らせ
スローフード共生発酵工学研究部会では発酵食品機能性データベースを更新しました。
⇒詳しくはこちら
Published by 部会：非線形バイオシステム on 10 6月 2020
非線形バイオシステム研究部会
非線形バイオシステム研究部会代表
東北大学グリーンクロステック研究センター
田丸 浩
本研究部会では、環境（条件）から何らかのシグナルに反応して状態を変える細胞情報を「非線形的」に解析する方法論を議論するとともに、これまで予測不可能であった環境的シグナルに反応する細胞情報をデータベース化することで、将来的な「非平衡パラメーター」として活用することを目指します。さまざまな生命現象の複雑な振る舞いに興味のあるウェット側の研究者から数理モデルなど理論に興味のあるドライ側の研究者まで、生物機能の再構築モデルのための「知識データベース」を共有したいと考える幅広い分野の方々からの積極的な参加を期待しております。
会員
| 田丸 浩 （東北大・グリーン） | 髙木 昌宏 （北陸先端大・マテリアル） | 堀 克敏 （名大・工） |
| 神谷 典穂 （九大・工） | 中村 史 （産総研） | 藤田 聡史 （産総研） |
| 梅津 光央 （東北大・工） | 座古 保 （愛媛大・理工） | 三宅 淳 （阪大・基礎工） |
| 中西 周次 （阪大・太陽エネセ） | 山口 哲志 （阪大・産研） | 黒田 章夫 （広島大・先端物質） |
| 吉野 知子 （東京農工大） | 秦 洋二 （月桂冠） | 大河内 美奈 （東工大・物質理工） |
| 田中 祐圭 （東工大・物質理工） | 黒田 浩一 （京工繊大・工芸科学） | 岡﨑 文美 （三重大・生物資源） |
| 青木 航 （阪大・工） | 川口 秀夫 （日揮） |
これまでの活動
- 2023年度 第1回非線形バイオシステム研究部会公開セミナー（2024/3/28）
- 2022年度 第1回非線形バイオシステム研究部会公開セミナー（2023/3/11）
- 2021年度 第2回非線形バイオシステム研究部会 公開セミナー（2022/3/29）
- 2021年度 第1回非線形バイオシステム研究部会 公開セミナー（2021/12/9）
- 第2回非線形バイオシステム研究部会公開セミナー（2020/12/17）
- バイオシステム研究部会 キックオフセミナー（2020/9/27）
- 生物工学Webシンポジウム2020：（WS10）非線形バイオシステム研究の現状と展望（2020/9/3）
お問合せ先
東北大学グリーンクロステック研究センター
田丸 浩
E-mail:
| 自然共生に学ぶ生物工学研究部会 | 代謝工学研究部会 | スローフード共生発酵工学研究部会 | メタボロミクス研究部会 | ナノバイオテクノロジー研究部会 | 次世代植物バイオ研究部会 | 未培養微生物（微生物ダークマター）資源工学研究部会 | 生物資源を活用した地域創生研究部会 | バイオインフォマティクス相談部会 | 次世代アニマルセルインダストリー研究部会 | バイオ計測サイエンス研究部会 | 脂質駆動学術産業創生研究部会 | 非線形バイオシステム研究部会 | 培養技術研究部会 | 生物工学若手研究者の集い（若手会）|
Published by 部会：脂質駆動学術産業創生研究部会 on 03 6月 2019
脂質駆動学術産業創生研究部会
脂質駆動学術産業創生研究部会代表
徳島大学大学院社会産業理工学研究部
櫻谷 英治
脂質研究領域のさらなる発展には多様な学術分野の融合と新規概念の導入が必要と考えられます。すなわち、新規機能性脂質の創出、脂質・脂質代謝物の正確なリピドーム解析、脂質代謝産物を介したヒト（細胞）と腸内細菌の相互作用解明、細胞への脂質の輸送と生理学的機能解明、機能性脂質の物性評価と合成技術開発などが重要となります。本研究部会では、脂質と脂質代謝物を鍵化合物とした新たな機能の開拓に基づき、産業の創出を駆動することを目指しています。これからの脂質研究に関する情報交換、産学官交流にご興味をお持ちの方に、毎年開催の講演会を中心とした本研究部会の活動に、ご参加いただければ幸いです。
2024年度第6回脂質駆動学術産業創生研究部会講演会を開催しました。
【日時】2024年10月4日（金）
【場所】北海道大学 工学部 フロンティア応用科学研究棟2階レクチャーホール（鈴木章ホール）
（世話人：北海道大学・菊川寛史）
⇒詳しくはこちら
構成員
| 代表 | 櫻谷 英治（徳島大・生物資源・教授） | |
|---|---|---|
| 委員 | 岸野 重信（京大院・農・准教授） | 安藤 晃規（京大院・農・助教） |
| 竹内 道樹（京都工繊大・分子化学・助教） | 菊川 寛史（北大院・工・准教授） | |
| 和泉 自泰（九大・生医研・准教授） | 高橋 政友（九大・生医研・助教） | |
| 中谷 航太（九大・生医研・助教） | 渡邉 研志（広島大院・統合生命・助教） | |
| 雜賀 あずさ（産総研） | ||
| オブザーバー | 小川 順（京大院・農) | 永尾 寿浩（大阪技術研) |
| 秋 庸裕（広島大院・統合生命） | 角田 元男 | |
| 岩崎 雄吾（中部大・応用生物） | 馬場 健史（九大・生医研） | |
| 杉森 大助（福島大院・理工） | ||
お問い合わせ先
徳島大学大学院社会産業理工学研究部
生物資源産業学域
櫻谷 英治
E-mail
| 自然共生に学ぶ生物工学研究部会 | 代謝工学研究部会 | スローフード共生発酵工学研究部会 | メタボロミクス研究部会 | ナノバイオテクノロジー研究部会 | 次世代植物バイオ研究部会 | 未培養微生物（微生物ダークマター）資源工学研究部会 | 生物資源を活用した地域創生研究部会 | バイオインフォマティクス相談部会 | 次世代アニマルセルインダストリー研究部会 | バイオ計測サイエンス研究部会 | 脂質駆動学術産業創生研究部会 | 非線形バイオシステム研究部会 | 培養技術研究部会 | 生物工学若手研究者の集い（若手会）|
Published by 学会事務局 on 25 5月 2018
【事務局より】2018年度の研究部会について
2018年4月24日の理事会にて以下14の研究部会設置申請が承認されました。
【第1種研究部会】
【第2種研究部会】
- 代謝工学研究部会
- スローフード共生発酵工学研究部会
- 学際的脂質創生研究部会
- メタボロミクス研究部会
- サスティナブル工学研究部会
- ナノバイオテクノロジー研究部会
- バイオインターフェイス研究部会
- 次世代植物バイオ研究部会
- 未培養微生物（微生物ダークマター）資源工学研究部会
- 生物資源を活用した地域創生研究部会
- バイオインフォマティクス相談部会
【若手研究会】
♦関連記事：研究部会の設置申請について
Published by 部会：バイオインフォマティクス on 28 4月 2017
バイオインフォマティクス相談部会
バイオインフォマティクス相談部会代表
産業技術総合研究所 人工知能研究センター
堀之内 貴明
分析技術の高度化と計算機性能の向上に伴い、膨大な生命情報から有用情報を抽出するための手段であるバイオインフォマティクス解析が、生物工学分野における重要性を増しています。しかしながら、このバイオインフォマティクス解析は、高度な専門知識を要し、ターゲットや目的によって多種多様の方法論が存在し、さらにはその手法も刷新を続けていることから、初学者にとっては敷居が高いと言わざるを得ません。また、そうした状況に対し、適切な教育やサポート体制の提供は不十分であることが多く、各研究者が独力で個別問題に取り組まざるを得ないという状況が頻出しています。また各種バイオインフォマティクス技術の専門家は必ずしも生物工学分野の人材であるとは限らず、その場合には目的やニーズの相違やコミュニケーションの問題を解決する必要が生じます。
そこで生物工学分野にフォーカスした解析サポート環境の整備や交流の場の形成、バイオインフォマティクスがわかる（できる）生物工学研究者の育成、研究活動の支援などを目的として当部会を2017年度に設立しました。当部会は、生物工学分野をバックグラウンドとしつつバイオインフォマティクス解析手法に精通した研究者が主体となって運営しています。これにより、バイオ系人材のバックグラウンドに即した目的やニーズに即した活動を行うことができます。これに加え、ウェット系研究者との連携を得意とするバイオインフォマティクスのプロフェッショナル研究者を外部有識者として擁しており、高度な支援や異分野交流のさらなる促進を実現する体制を整えています。
これまでに相談窓口の運営、ノートPCを持ち込んでデータ解析方法を学ぶハンズオンセミナー、情報交換と交流を目的とした講演会などを開催してきました。また、これまでに講演会開催に際して学会内の他の研究部会（バイオ計測サイエンス研究部会、次世代アニマルセルインダストリー研究部会、未培養微生物（微生物ダークマター）資源工学研究部会）の協力を仰ぎ、部会共通のトピックの設定や、登壇者選定や開催告知の面での連携を進めてきました。こうした部会間の連携の強化をはかることにより、本部会の活動をさらに有機的なものとし、学会組織や学会員に対する幅広い貢献を目指して活動を行っています。
バイオインフォマティクスに興味のある方々はぜひ本部会の活動にご参加ください。当ページ下部に活動内容一覧を記しております。
■お知らせ
・New DIY自動化ハンズオンセミナーを開催しました（2024/3/15）。
・ バイオインフォマティクス相談窓口における生成系AIの使用に関する基本方針を策定しました。
・2023年度大会シンポジウムにおいて「データ駆動型研究が導く未培養微生物 (微生物ダークマター) の開拓と展望」(2023年9月5日)をオーガナイズしました。未培養微生物（微生物ダークマター）資源工学研究部会の青柳秀紀先生（筑波大学）との共催でした。
・相談窓口にてタンパク質立体構造予測プログラムのAlphaFold2の解析サポート始めました。
・部会委員が執筆を行った総説が公開されました。（Uesaka et al., Bioinformatics in bioscience and bioengineering: Recent advances, applications, and perspectives, J. Biosci. Bioeng., In Press）Society for Biotechnology, Japan 100th Anniversary Special Issue
・部会委員が編集協力、分担執筆を行った書籍が発刊されました。（実験医学別冊 論文図表を読む作法 第7章 NGSなどを用いた網羅的解析を担当しました）
・活動記録、研究部会業績、資料アーカイブ、関連リンク集をそれぞれ独立ページにしました。
活動内容
■相談窓口 (リンク)
各種のバイオインフォマティクス解析手法に精通した生物工学研究者により構成される相談窓口を運営しております。
AlphaFold2の解析相談も受け付けております。
■一般部会員メーリングリスト
生物工学会におけるバイオインフォマティクス分野の活性化と情報共有、交流を目的として、部会メーリングリスト（ML）を運営しております。一般部会員になっていただくことでMLに登録され、当該分野の関連情報や部会が主催するイベント等の告知についてのメールを受信できます。またMLに情報を発信することも可能です。
一般部会員への登録をご希望の方は、メールの件名または本文に「バイオインフォマティクス相談部会 一般部会員希望」とご記入の上、代表宛（E-mail）までご連絡下さい。
■各種研究会合の開催
生物工学分野の内外から、バイオインフォマティクス技術を利活用されている先生方をお招きし、交流の場を設けております。奮ってご参加下さると幸いです。
■これまでの活動記録 (リンク)
■研究部会業績 (リンク)
本部会の活動がきっかけになった共同研究や、相談窓口への投稿が元になった成果などをとりまとめています。
■資料アーカイブ (リンク)
本部会活動においてこれまで作成・運用されたコンテンツをご覧になることができます。
■関連リンク集 (リンク)
運営委員
| 代表 | 堀之内 貴明（産総研・人工知能研究センター） |
|---|---|
| 幹事長 | 兒島 孝明 (名城大・農) |
| 会計 | 蟹江 慧 (近畿大・工) |
| 委員 (順不同) | 加藤 竜司 (名大院・創薬科学) |
お問合せ先
産業技術総合研究所 人工知能研究センター
堀之内 貴明 問い合わせ先：(1)E-mail, (2)E-mail
| 自然共生に学ぶ生物工学研究部会 | 代謝工学研究部会 | スローフード共生発酵工学研究部会 | メタボロミクス研究部会 | ナノバイオテクノロジー研究部会 | 次世代植物バイオ研究部会 | 未培養微生物（微生物ダークマター）資源工学研究部会 | 生物資源を活用した地域創生研究部会 | バイオインフォマティクス相談部会 | 次世代アニマルセルインダストリー研究部会 | バイオ計測サイエンス研究部会 | 脂質駆動学術産業創生研究部会 | 非線形バイオシステム研究部会 | 培養技術研究部会 | 生物工学若手研究者の集い（若手会）|
Published by 部会：次世代植物バイオ on 16 6月 2014
次世代植物バイオ研究部会
次世代植物バイオ研究部会研究部会代表
大阪大学大学院工学研究科
村中 俊哉
従来のバイオテクノロジーに加え、精密かつ包括的な代謝物分析、大規模遺伝子解析技術、環境制御技術の発展、さらには、ゲノム編集などの新植物育種技術（NBT）の開発やAIとの融合などにより、植物バイオが、産業化につながる技術として注目されています。本研究部会では、植物分野の他の研究会とも連携を図り、日頃のメーリングリストによる情報交換、国内・国際セミナーの開催などを行い、未利用の植物機能の解明とその応用を目指します。民間企業の方、学生会員を含め、幅広い学会員の参加を募ります。これから植物バイオ研究をやってみよう、という学会員も是非ご入会ください。
委員
| 村中 俊哉（阪大院・工） | 岡澤 敦司（大阪公大・生命環境） |
| 田口 悟朗（信州大・繊維） | 梶浦 裕之（阪大・生物工学国際セ） |
| 安本 周平（阪大院・工） | 魚住 信之（東北大院・工） |
| 大橋貴生（摂南大学・理工） | 加藤 晃（奈良先端大・バイオサイエンス） |
| 梶山 慎一郎（近畿大・生物理工） | 關 光（阪大院・工） |
| 中澤慶久（徳島大・生物資源） | 中山 亨（東北大院・工） |
| 原田 和生（阪大院・医） | 福井希一（阪大院・工 名誉教授） |
| 藤山 和仁（阪大・生物国際セ） | 松田 史生（阪大院・情報） |
| 松浦 秀幸（阪大院・薬） | 三﨑 亮（阪大・生物国際セ） |
| 森川 正章（北大院・工） | 浜本 晋（東北大院・工） |
| 高橋 征司（東北大院・工） | 堀江 智明（信州大・繊維） |
| 加藤 康夫（富山県立大・工） | 池澤 信博（三菱化学科学技術研究センター） |
問合せ先
大阪大学大学院工学研究科
村中 俊哉 E-mail
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Published by 学会事務局 on 24 2月 2011
過去の研究部会 – 微生物共生活用発酵工学研究部会［前身：微生物の寄生・共生から探る伝統醸造の深淵研究部会］（2011年～2015年）
伝統食品の醸造の多くは、複数の微生物が寄生・共生により複雑な微生物相を構成して達成されてきたものだと考えられる。これらの微生物間の相互作用を探ることは、先人達が守り継承してきた伝統醸造の深淵を理解することでもある。本部会では、最先端の技術を使って、共生している酵母・乳酸菌・酢酸菌・麹菌などの微生物や、内在寄生生物であるミトコンドリアの相互作用を明らかにし、得られた知見をもとに新たな次世代型発酵の可能性を考えることを目的とする。
連絡先 ktgkhrs アットマークを付ける cc.saga-u.ac.jp
データベース－文献リスト
- 発酵微生物の寄生・共生に関わる文献リストはこちら
本研究会の趣旨に沿う文献のうち、Pubmedなどの公的データベースで検索しにくいものを集めました。伝統発酵微生物の研究を行う方にご活用いただければと思います。
- 伝統醸造食品の微生物共生に関わる重要な論文（年代順）はこちら
○研究リソース
産学官連携を促進するため、伝統醸造・発酵に関わる微生物やその共生の研究をしている研究室のリソースをまとめました。ご活用いただければと思います。
●奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科 ストレス微生物科学研究室（高木研究室）
○研究室のリソース： 有用微生物（酵母、大腸菌など）の育種技術（突然変異、接合、セルフクローニング、遺伝子組換えなど）、アミノ酸の代謝制御・生理機能の解析技術、アミノ酸の定量法、硫黄化合物のモニタリング法、酵素機能の解析と改変技術（ランダム・部位特異変異）、細胞内タンパク質の局在解析技術、酵母ミトコンドリア・液胞の解析技術、活性酸素種・活性窒素種の定量法、各種環境ストレス耐性の評価法など。
○研究内容： 酵母、細菌などの微生物が有する様々な細胞機能について、環境ストレス（酸化・還元、温度、水分、浸透圧、化学物質、栄養など）への新しい適応機構を中心に、分子・代謝・細胞レベルで詳細な解析を行ない、微生物の複雑かつ巧妙な機能に対する理解を深めます。また、得られた研究成果を有用な微生物育種、物質生産などの技術開発に応用し、食糧、エネルギー、環境、生命に関連するバイオテクノロジーに貢献することを目指しています。
HPアドレス： http://bsw3.naist.jp/takagi/takagi-j.html
問い合わせ先： 教授 高木博史 hiro (atmark) bs.naist.jp
●東京大学大学院農学生命科学研究科 応用生命工学専攻 微生物学研究室
○研究室のリソース：麹菌の細胞生物学解析の技術 （タンパク質分泌やオートファジーなどの膜輸送。糸状菌特異的オルガネラWoronin bodyによる多細胞生物としての生存維持装置など）。
麹菌の育種技術の開発 （効率的な多重遺伝子破壊のための技術。有用変異株のスクリーニング技術。菌糸融合・有性生殖の誘導による交配技術の開発）。
麹菌の異種タンパク質生産への利用 （様々な異種タンパク質高生産宿主の開発。動物由来、植物由来の各種有用タンパク質の生産実績）。
○研究内容：麹菌の細胞内におけるオルガネラやタンパク質の動きという基礎的な観点から、産業有用株育種への応用を行っている。さらに、麹菌の育種技術に改良を加えることで、有用タンパク質の効率的な生産を行っている。
HPアドレス http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/Lab_Microbiology/hyousi.html
問い合わせ先 教授：北本勝ひこ akitamo (atmark) mail.ecc.u-tokyo.ac.jp
●九州大学大学院農学研究院 生命機能科学部門 分子微生物学・バイオマス資源化学講座 微生物工学研究室（園元謙二、中山二郎、 善藤威史）
○研究のリソース： 乳酸菌等の有用微生物の分離技術、分離株ライブラリー、乳酸発酵とその解析技術、アセトン・ブタノール・エタノール発酵と その解析技術、抗菌ペプチド・バクテリオシンの探索と評価、バクテリオシンの精製・構造解析・遺伝子解析技術、クオラムセンシングの評価技 術、クオラムセンシング阻害剤の探索と合成、ヒトおよび食品中の網羅的細菌叢解析技術
○研究内容： 食品・医薬・環境保全技術への微生物利用を目的とした、新奇微生物・微生物由来新奇物質の探索、分子育種、微生物叢解析、および 生理活性物質・バイオ燃料などの有用物質生産への工学技術の開発に関する研究を行っている。
HP： http://www.agr.kyushu-u.ac.jp/lab/microbt/
問い合わせ先： 助教 善藤威史 zendo (atmark) agr.kyushu-u.ac.jp
●琉球大学農学部亜熱帯生物資源科学科 発酵微生物学研究室
○研究室のリソース：酢酸菌、酵母、泡盛黒麹菌を中心とした発酵微生物の生化学的解析（酵素化学的解析、糖組成分析）、分子生物学的解析（遺伝子組換え技術）、新規発酵微生物のスクリーニング、発酵産物の成分評価、官能評価、製麹技術
○研究内容：酢酸菌による発酵生産、酢酸菌が生産する補酵素ピロロキノリンキノン、泡盛黒麹菌のルーツや醸造特性の研究を通して、発酵微生物の開発と産業への利用を目指しています。
HPアドレス http://www.agr.u-ryukyu.ac.jp/wp/pqq-quinoprotein
問い合わせ先 教授：外山博英 toyama (atmark) agr.u-ryukyu.ac.jp
助教：渡邉泰祐 t-wata (atmark) agr.u-ryukyu.ac.jp
●日本大学生物資源科学部 食品生命学科 食品微生物学研究室（森永 康・古川 壮一）
○研究室のリソース：酵母、乳酸菌、酢酸菌等食品有用微生物の相互作用解析技術、食品有用微生物の分離技術・分離菌株ストック、大腸菌、乳酸菌、酵母の遺伝遺伝子工学実験系 など
○研究内容：伝統的発酵における微生物間相互作用に関する研究、バイオフィルムの利用と制御に関する研究 など
HPアドレス： http://hp.brs.nihon-u.ac.jp/~shokubi/
問い合わせ先：准教授；古川壮一 furukawa.souichi (atmark) nihon-u.ac.jp
●佐賀大学農学部生物環境科学科 北垣研究室
○研究室のリソース：醸造酵母のミトコンドリア解析、醸造酵母の育種技術（交配育種、突然変異育種、遺伝子組換技術）、有機酸解析技術、セラミド定量・精製・構造解析技術、脂肪酸解析技術、麹菌培養技術、麹造り技術、官能評価技術、香気成分測定技術。
○研究内容：醸造酵母のミトコンドリアや麹菌のセラミドをアプローチとして、醸造微生物の共生や生理活性物質を明らかにすることを目指しています。
HPアドレス： http://seisansystem.ag.saga-u.ac.jp/index.html
問い合わせ先： 准教授 北垣浩志 ktgkhrs (atmark) cc.saga-u.ac.jp
○産学官連携研究の例
本研究部会の委員が育種を行い、産官学連携により実用化されている醸造酵母の事例をまとめました。
●尿素非生産性清酒酵母
東京大学大学院農学生命科学研究科の北本勝ひこ教授（当時：国税庁醸造試験所）は、カナバニン・オルニチン・アルギニンの適正な濃度を含む培地で選択することにより、positive selectionでアルギナーゼ欠損・尿素非生産性清酒酵母を育種する育種手法を考案され、実用化されました。特に輸出用清酒の製造に現在に至るまで広く使われており、日本醸造協会から全国に頒布されています。
Journal of Fermentation and Bioengineering, 75, 5, 359-363 (1993)
Mutant isolation of non-urea producing sake yeast by positive selection.
Katsuhiko Kitamoto, Kaoko Oda-Miyazaki, Katsuya Gomi, Chieko Kumagai
●イソアミルアルコール高生産泡盛酵母
奈良先端科学技術大学院大学 高木博史教授らは、株式会社バイオジェット、琉球大学と共同研究を行っている沖縄県「琉球泡盛調査研究支援事業」の一環として、イソアミルアルコールを高生産する泡盛酵母（101H酵母）を育種しました。また、来年度中の商品化をめざし、新里酒造で泡盛の試験醸造を行うことになりました。
Journal of Bioscience and Bioengineerng, 2015 Feb;119(2):140-7. doi: 10.1016/j.jbiosc.2014.06.020.
Isolation and characterization of awamori yeast mutants with l-leucine accumulation that overproduce isoamyl alcohol.
Takagi H, Hashida K, Watanabe D, Nasuno R, Ohashi M, Nezuo M, Tsukahara M.
記事掲載
http://ryukyushimpo.jp/news/storyid-239237-storytopic-4.html
●ピルビン酸低減清酒酵母
佐賀大学農学部の北垣浩志准教授は、ミトコンドリアを活性化しピルビン酸を輸送・代謝させるという戦略でピルビン酸が低減した清酒酵母を育種する育種手法を考案され、実用化されています。本酵母は日本醸造協会から全国に頒布されています。
Journal of Bioscience and Bioengineering, 117(4):383-93. doi: 10.1016/j.jbiosc.2013.09.01
Mitochondrial metabolism and stress response of yeast: Applications in fermentation technologies.
Kitagaki H, Takagi H.
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry. 2010;74(4):843-7.
Breeding of a low pyruvate-producing sake yeast by isolation of a mutant resistant to ethyl alpha-transcyanocinnamate, an inhibitor of mitochondrial pyruvate transport.
Horie K, Oba T, Motomura S, Isogai A, Yoshimura T, Tsuge K, Koganemaru K, Kobayashi G, Kitagaki H.
http://www.nikkan.co.jp/news/nkx1020141218eaag.html
産学官連携に関するアンケート
本研究部会委員に、産学官連携に関するアンケートを行い、その結果を取りまとめたものです。
１ 企業の方：
大学・公的研究機関に期待する発酵微生物関連の研究は何ですか。
（企業）大学や公的機関では、機能性の研究は多数あるのですが、”発酵”等モノ作りの部分に関する研究はほぼ皆無です。 商品として最も重要なモノ作りの部分で、大学や公的研究機関と共同研究が出来るようになればと感じます。
（企業）発酵微生物（実用株）が有している特性に関する基礎研究です。
そのメカニズムを解明することで，応用研究，実用化に繋げることができます。
（企業） 発酵微生物関連の研究が理学的な方面に向う傾向が強くでており、ものづくりのおもしろさとの関連が希薄になっているように感じます。 新しく入社する学生のなかにも、ものづくりのおもしろさではなく、生物機能の解明だけに興味を持ち、その機能をものづくりに利用することのワクワク感や重要性を価値感として持っていない方が増えているように思います。 そこで、ものづくりの可能性を追求する姿勢を土台にした発酵微生物の研究・教育を大学・公的研究機関にも期待しています。
（企業）分野は特に限定されませんが、「新規事業をイメージできる研究」が望ましいです。もちろん、事業化には多くの課題があるはずですが、ゴールと課題を明確に意識した研究が重要です。
（企業）・モデル生物だけでなく実用微生物でも役立つ（実用微生物の）基礎研究。
・遺伝子組換え体（GMO)のPAを得られるような研究活動。（会社ではできません）
（企業）発酵食品を対象として、微生物共生の視点から本質に迫るようなおもしろい研究を期待しています。発酵食品は世の中にたくさんありますし、どのような微生物が存在しているかも知られているケースは多いと思います。しかし、実際の発酵食品は固体やペースト状のものが多く、発酵基質の状態やそこに潜んでいる微生物共生の観点からみると、まだまだ未知な部分が多い上に、十分に検証されていないケースもあると思います。地味な部分もありますが、「微生物共生」の視点で発酵食品が検証されてくると物事も見えかたも変わるでしょうし、「発酵食品」のよさを伝えるあらたな一面や「発酵食品」を作る際の本質的な側面など分かり、それに関わる研究が盛り上がるのではないかと考えています。
（企業）基礎的な原理に近い研究。さまざまな方面に応用可能な技術。
大学・公的研究機関の方：
大学・公的研究機関に期待されていると思われる発酵微生物関連の研究は何ですか。
（大学・公立）培養工学や生物化学工学の教科書に混合培養系のプロセス制御についての記述はほとんどありません（あったとしても活性汚泥プロセスを取り上げているぐらいです）。混合培養系のプロセス制御には，まず生態学的な要素が入るという難しさが一つあり，バイオフィルムのような形態を用いる場合は移動速度論的な要素が入るのでさらに難しくなります。分子生物学的解析から得られる情報に加え，数理モデルやシミュレーション技術などを積極的に採り入れることが重要かと思います。
（大学・公立） 真に役立つ実学的研究（また、防衛的特許ではなく、真の特許が取得できるなど）かと思っております。
（大学・公立） 発酵微生物を用いた、独自の視点に基づくオリジナリティーのある基礎的な研究であると思います。科学的観点からもサイエンスへの貢献が期待でき、同時に産業への貢献も期待できるような内容の研究であると思います。
（大学・公立）革新的な、あるいは普及していないアプローチによる、もしくは創造的な発想に基づく、発酵の実用的かつ困難な研究に大学、公的研究機関の研究者は取り組むべきと考えます。
（大学・公立）トランスレーショナルな応用研究でレベルの高い、革新的な研究が必要と思います。
（大学・公立）微生物学だけにとらわれることなく幅広い分野を見渡した総合的な発酵の研究を進めることが必要と思います。
（大学・公立） 大学は、教育＋研究
公的研究機関（独法）は、研究＋研究(製品）開発上の問題解決
（大学・公立）シーズの発掘であると考えております。企業における研究レベルは極めて高く なっていると認識しております。ただし、リターンに関するリスクが大きいテーマについて は、大学や公的研究機関が担うべきであると考えております。シーズの発掘におきましては、科学的な裏打ちをしっかりしていくことが重要かと思います。
（大学・公立）企業では取り組めない先端的、革新的な研究で、かつ実用化意識した研究が期待されていると思います。
２これからの時代の発酵関連企業と大学・公的研究機関の産学官連携のあるべき姿や望ましい関係について記述してください。
（企業）企業では、すぐに結果の出ない（売上や利益にすぐに直結しない）、１０年先、２０年先を見据えた研究というのは、やりにくので、大学・公的研究機関には、このような研究に関してはこれまで通り進めてもらいたいと思います。ただし、常にアウトプットを強く意識した研究が必要と思います。
（企業）日本発の、世界をリードできる事業の創成と推進を期待しております。
（企業）企業側に課題が発生した場合に，大学・公的研究機関とのネットワークを通じて相談できる相手の「顔」が思い浮かぶことが大事だと思います。
（企業）企業の研究開発者がワクワクする研究開発テーマをイメージするための価値や技術のシーズが大学公的研究機関から出てくることを期待しますが、企業研究者と大学・公的研究機関の情報の交換が密になることが、その基盤になると思いますので、明確な意図を持たない段階からの情報の交換がより密になることが重要になってくるように思います。
（企業）・現在の産学連携には、企業が対価を払っても「是非とも欲しい成果」のみが大学に求められます。そのためには、新規事業がイメージできる必要があります。
・極端にいうと、「企業による大学の成果活用を期待」ではなく、「大学主体で企業を活用して成果を事業化」を意識する努力が必要と考えます。
（企業）大学等の公的機関からのシーズ提案、会社からのニーズ発表（クローズドが望ましい）のマッチングが効率よくできること。
（企業）企業としては、「製品」を通して、社会に貢献することはできると思いますし、運がよければ「製品」を通して、世の中で流行を作りだすことはできると思います。しかし、企業の一製品が売れることで、産官学の研究が大きく発展するような事例は少ないのではないでしょうか？
一方で麹菌を「国菌」として認定し、それによって産学官における麹菌を利用した研究や産業（酵素、食品など）が確実に盛り上がっているのはよい事例ではないでしょうか？学官を含む学会が「国菌」として旗揚げし、様々な報告が増えるなかで、研究が活発化し、研究者間が結束することで大きなウェーブができ、結果としていくつかの産業が大きく発展するような流れが理想だと考えています。
（企業）大学と直接共同研究する利点が少なくなっている。法人化されたため知財の問題等あって大学とは組みにくい。海外のように大学からスピンアウトしたベンチャーであれば、日本の研究も進むような気がする。
（大学・公立）昭和の中盤くらいまでの企業では研究ができなく大学が研究の機能を担っていた時代とは役割分担が異なっているとは思いますが、一方で日本の産業の世界での地位が低下するに伴い、過去20年間の米国に次ぐ超大国であった時代の「基礎研究重視」の空気とは異なった役割が大学には与えられるべきと考えます。「基礎研究、応用研究」という区分け自体が特定のパラダイムを誘導するものなのでこの区分けをやめる発想の転換の時期に来ています。世界の中でいかにオンリーワンのコンテンツを発酵の分野で産学官連携により開発し新産業を創出できるかが問われていると思います。
（大学・公立）製造現場の問題解決に資する研究は、今後も引き続き重要と思います。
（大学・公立）新たな技術開発につながる革新的かつ困難な研究に大学は取り組み、それをもとに企業が新市場を開拓する姿が大事と思います。
（大学・公立） 大学・公的研究機関は独自の視点に基づくオリジナリティーのある基礎的な研究を推進・展開し、企業は興味をもった研究者と相互にコミュニケーションをとりながら、共同研究でしかできないような方向を志向しながら、基礎・応用の両面に展開させることが、望ましい姿ではないかと思っております。
（大学・公立）企業秘密や同業者間競争があるため、情報をオープンにした連携は難しいのではないか。
業界共通の課題を見つけ、産学官共同で公的研究助成費を獲得する。
（大学・公立）大学や公的機関で発掘したシーズを高度な技術を有する企業の研究者が、現場レベルに落とし込んでいくという形がよろしいのではと感じております。そのためには、 大学や公的機関がいかに科学的に高水準なデータを取得しておく必要があるように思います。
（大学・公立）大学・公的研究機関の研究テーマ設定の際に、企業側のニーズを意識する姿勢があっても良いと思います。
３これまでの活動を踏まえ、今後微生物共生活用発酵工学研究部会に期待することを記述してください。
（企業） 本部会は、常に応用を意識した基礎研究が中心となってますので、このままのスタンスでいっていただきたいと願います。
企業に属する者の立場としては、「微生物共生活用発酵工学研究部会」は、非常に素晴らしいものであると感じております。
（企業）この研究部会が「産学連携の在り方を考える」を担う部会であることを内外に示すこと、および、部会メンバーの交流を促進する施策（定例会やセミナー）等を実施継続すること。
（企業）・実績を積んで、発言力を持つような研究会に成長することを期待します。
・大学・公的研究機関と企業のマッチングの場の提供。
（企業）
①微生物共生を大きな旗として上げること
②そのツールを準備して提供すること
③これらを私利私欲に流されずに、高い理念を持って推し進めること。
を期待しますし、それによって、色んな企業を含む「産」が後からついてくるような形が望ましい関係であると思います。
また、部会のレベルにとどまらず、研究者間が結束し、大きな「微生物共生」の波を作っていくことが必要ではないかと考えています。
（企業）知の結集というか、さまざまな知をMIXすることで新しいことのヒントになるような場を開催すること。
（企業）企業と大学・公的研究機関とのネットワークの「場」として今後も期待します。
（大学・公立） 「共同研究が組みやすい、ソフトな環境作りのサポート」でしょうか。
（大学・公立） 部会員がそれぞれ独自の視点に基づく研究・開発活動を展開し、個々に情報交換を行いながら、シンポジウムなどを通して新しい情報を発信してゆくことが重要であると思います。産学官情報交流でしょうか。そのようなことを通して、発酵産業の発展に貢献することが、本部会に求められることであると思います。そのためには、若手を中心に、フレキシブルに運営をすることが大切であると思います。
加えまして、実際に部会員の企業の方からご相談を受けることもございます。一般化することは難しいのかもしれませんが、そのような取り組みをすることも大切なのではないかと思っております。
（大学・公立）システマティックな大学・公的機関と企業のマーケティングは、国ベースで進めるべき課題であると認識しております。研究部会では、それを下支えするような、人的なレベルでの交流を促進に貢献したらいいように感じられます。
（大学・公立）現在の発酵工学で足りない分野を洗い出し、産学官連携のきっかけの場となることを期待しております。
これまでの活動
- シンポジウム開催
- 文献データベースの作成と公開
- 伝統発酵食品工場の見学と情報収集
- Fuji sankei business iへの記事の執筆
- 「伝統的発酵で新たな活用法（上）」
2010年10月20日掲載 - 「伝統的発酵で新たな活用法（下）」2010年11月17日掲載
- 「伝統的発酵で新たな活用法（上）」
- メーリングリストによる文献情報交換
- 生物工学会誌への特集記事企画・執筆（生物工学会誌第89巻8号）
リンク
Published by 学会事務局 on 26 9月 2008
過去の研究部会 – スローフード微生物研究部会 – 発酵食品機能性データベース（2011年まで）
スローフード微生物工学研究部会では、発酵食品の機能性データベースを作成中です。これらのデータベースをさらに充実したものにするために、皆様からの新たな情報をお寄せいただきたいと思います。お気づきの点、新情報をお寄せください。
⇒最新版データベースについてはスローフード共生発酵工学研究部会のサイトをご覧ください。
【日本酒 機能性データベース】
Nihonshu_2011.xls
採録基準
対象： 日本酒とその原材料・副産物 （酵母・麹菌・米麹・酒粕・米糠など)
公開日： 原則として1990年以降とする
発表方法： 公開特許、総説、原著論文、学会発表 等
宛先： 秦洋二（月桂冠株式会社 総合研究所）
【醤油 機能性データベース】
Shoyu_2011.xls
採録基準
対象： 醤油とその原材料・副産物
発表方法： 公開特許、総説、原著論文、学会発表 等
宛先： 古林万木夫
（ヒガシマル醤油株式会社研究所）
【味噌、納豆 機能性データベース】
Miso2011.xls, Natto 080111.xls
採録基準
対象： 上記と同様
発表方法： 公開特許、総説、原著論文、学会発表 等
宛先： 柏木 豊（東京農業大学）
【食酢 機能性データベース】
su_2010.xls
採録基準
対象： 上記と同様
発表方法： 公開特許、総説、原著論文、学会発表 等
宛先： 石井 正治（東京大学）
【焼酎 機能性データベース】
shochu20111103.xls
採録基準
対象： 上記と同様
発表方法： 公開特許、総説、原著論文、学会発表 等
宛先： 北垣浩志（佐賀大学）
【梅酒 機能性データベース】
Umeshu.xls
採録基準
対象： 上記と同様
発表方法： 公開特許、総説、原著論文、学会発表 等
宛先： 赤木 知裕（チョーヤ梅酒（株））
Published by 学会事務局 on 26 9月 2008
過去の研究部会 – スローフード微生物工学研究部会（2003年～2015年）
近年、伝統的食品を再評価したスローフード運動が展開されています。日本のスローフードを代表し、食品機能的にも優れた伝統的発酵食品を生み出すスローフード微生物の研究は長い歴史をもっていますが、ゲノム科学の進展により、醸造や発酵に関わるスローフード微生物の機能が分子生物学的手法で解明できる時代を迎えています。本研究部会は、スローフード微生物を分子生物学的手法で研究している研究者で構成されています。研究情報の交換を行うことにより、スローフード微生物研究を新たな切り口から見直し、産業の創出、健康維持・病気の治療など分野での貢献を視野に入れた技術開発の展望を提示することを目的として活動を続けています。⇒研究概要図
興味ある方はぜひ部会員としての登録をお願いします。
構成員
| 代表 | 秦 洋二（月桂冠（株）） | |
|---|---|---|
| 委員 | 秋田 修（実践女子大学） | 石井 正治（東京大学農学生命科学研究科） |
| 相木 豊（東京農業大学醸造科学科） | 北垣 浩志（佐賀大学） | |
| 北本 勝ひこ（東京大学農学生命科学研究科） | 木村 啓太郎（（ 独）食品総合研究所） | |
| 古林 万木夫（ヒガシマル醤油（株） ） | 五味 勝也（東北大学農学研究科） | |
| 下飯 仁（岩手県立大学） | 中島 春紫（明治大学農学部） | |
| 橋爪 克己（秋田県立大学） | ||
リンク
Published by 学会事務局 on 28 7月 2008
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その他の出版物
- 《日本生物工学会創立90周年記念出版》生物工学よもやま話－実験の基礎原理から応用まで－
- 《日本生物工学会創立90周年記念出版》基礎から学ぶ生物化学工学演習
- 《日本生物工学会創立90周年記念出版》『ひらく、ひらく「バイオの世界」』
⇒『ひらく、ひらく「バイオの世界」』イラスト・写真館 - キャリアパス－生物工学研究者の進む道－
- 未来をつくるバイオ ─酒づくりから再生医療まで60 ─
- 生物工学ハンドブック
- 生物工学実験書
- 生物工学会誌・ミレニアム特別号 「発酵工学・20世紀のあゆみ」―バイオテクノロジーの源流を辿る―
- 日本生物工学会 80年史
支部活動
研究部会(若手会)
【第2種研究部会】
- 代謝工学研究部会
- スローフード共生発酵工学研究部会
- メタボロミクス研究部会
- サスティナブル工学研究部会
- ナノバイオテクノロジー研究部会
- バイオインターフェイス研究部会
- 次世代植物バイオ研究部会
- 未培養微生物（微生物ダークマター）資源工学研究部会
- 生物資源を活用した地域創生研究部会（グローカルバイオ研究部会）
- バイオインフォマティクス相談部会
- 次世代アニマルセルインダストリー研究部会
- バイオ計測サイエンス研究部会
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【若手研究会】
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